基于中华猕猴桃“红阳”转录组序列开发EST-SSR分子标记(英文)

编号 zgly0000898927

文献类型 期刊论文

文献题名 基于中华猕猴桃“红阳”转录组序列开发EST-SSR分子标记(英文)

学科分类 220.35;野生动物保护与管理

作者 孟蒙  唐维  刘嘉  黄胜雄  余进德  刘方方  林琳  张霞  刘永胜 

作者单位 四川大学生命科学学院/水力学与山区河流开发保护国家重点实验室/生物资源与生态环境教育部重点实验室  合肥工业大学生物与食品工程学院 

母体文献 应用与环境生物学报 

年卷期 2014(4)

页码 564-570

年份 2014 

关键词 中华猕猴桃  遗传分析  转录组  重复单元  SSR  种质资源 

文摘内容 为开发猕猴桃EST-SSR标记,了解28个品种猕猴桃间的遗传多样性和遗传关系,对中华猕猴桃红阳的转录组序列进行分析,并根据分析结果设计SSR引物.之后采用CTAB法提取28个品种猕猴桃的DNA作为SSR-PCR的扩增模板,并根据扩增结果进行聚类分析.研究中共得到包含SSR的序列21 848条,其中重复单元为单碱基、双碱基、三碱基、四碱基、五碱基和六碱基的序列分别为1 642、15 965、3 141、248、368和484条,随机选择其中46条序列设计SSR引物。