陆地棉XTH基因家族全基因组鉴定及在纤维发育过程的表达分析

编号 zgly0001566087

文献类型 期刊论文

文献题名 陆地棉XTH基因家族全基因组鉴定及在纤维发育过程的表达分析

作者 安亚茹  杨君  刘正文  张桂寅  马峙英  王省芬 

作者单位 河北农业大学/河北省作物种质资源重点实验室/教育部华北作物种质资源重点实验室 

母体文献 植物遗传资源学报 

年卷期 2017年06期

年份 2017 

分类号 S562 

关键词 陆地棉  木葡聚糖内转糖苷酶/水解酶家族  生物信息学分析  纤维发育  表达量 

文摘内容 本研究从陆地棉TM-1基因组中鉴定出72个XTH家族基因,编码木葡聚糖内转糖苷酶/水解酶(XTH,xyloglucan endotransglycosylase/hydrolase),分别命名为Gh XTH01~Gh XTH72,分析了其基因结构、保守基序、系统进化、理化性质、亚细胞定位,并探究其在棉纤维发育不同时期的表达规律。结果表明,XTH家族基因分布在除At 07、Dt 07以外的24条棉花染色体上,根据系统发育树,将XTH家族基因分为3个亚组;XTH氨基酸序列有3个保守基序,保守性较强;多数XTH蛋白定位在细胞外。根据XTHs在纤维发育不同时期的表达量变化,将其分为4类。通过构建陆地棉与拟南芥XTH氨基酸序列进化树,推测Gh XTH15、Gh XTH28、Gh XTH36、Gh XTH49、Gh XTH59、Gh XTH62、Gh XTH63等基因在棉纤维发育过程中发挥重要作用。通过比较XTH家族基因在不同纤维品质陆地棉品种中的表达差异,推测在优质棉花品种中优势表达基因Gh XTH03、Gh XTH12、Gh XTH17、Gh XTH22、Gh XTH23、Gh XTH28、Gh XTH33、Gh XTH44、Gh XTH46、Gh XTH59等在纤维发育伸长过程中可能发挥着重要作用。上述结果为研究陆地棉XTH基因家族在棉纤维发育中的功能提供了参考依据。