嗜线虫致病杆菌属Pir毒素基因克隆和生物信息学分析

编号 zgly0001554571

文献类型 期刊论文

文献题名 嗜线虫致病杆菌属Pir毒素基因克隆和生物信息学分析

作者 杨晴  张杰  李天慧  南宫自艳  王勤英 

作者单位 河北农业大学植物保护学院  河北省承德市滦平国有林场管理处 

母体文献 中国植保导刊 

年卷期 2017年09期

年份 2017 

分类号 S476 

关键词 嗜线虫致病杆菌  Pir毒素  基因克隆  序列分析  生物信息学分析 

文摘内容 采用基因组DNA提取法和目的基因PCR扩增对嗜线虫致病杆菌(Xenorhabdus nematophila)HB310(Xn HB310)菌株中的pirA和pirB基因进行克隆及生物信息学分析。结果表明,pirA全长408 bp,pirB全长1 290 bp;其蛋白PirA分子量为14.9 kDa,含135个氨基酸,PirB分子量为48.2 kDa,含429个氨基酸;二级结构分析表明PirA无α-螺旋,含12个β折叠,PirB含8个α螺旋和12个β折叠;亚细胞定位表明PirA和PirB主要分布在细胞核;PirA不含跨膜结构域和信号肽,PirB含有跨膜结构域和凝集素结构域,不含信号肽。