萝卜基因组DNA的RAMP-PCR体系优化

编号 zgly0001316840

文献类型 期刊论文

文献题名 萝卜基因组DNA的RAMP-PCR体系优化

作者 龚义勤  李培  王明霞  赵丽萍  柳李旺 

作者单位 南京农业大学作物遗传与种质创新国家重点实验室南京农业大学园艺学院  南京农业大学作物遗传与种质创新国家重点实验室南京农业大学园艺学院 南京210095  南京210095 

母体文献 植物研究 

年卷期 2006年01期

年份 2006 

分类号 S631.1 

关键词 萝卜  RAMP标记  体系优化  遗传多样性 

文摘内容 以萝卜为材料,对基因组DNA的RAMP分析体系中的Mg2+、dNTPs和引物浓度进行优化。分别设计3个浓度梯度:Mg2+为0.75、1.5、3.0 mmol.L-1;dNTPs为0.05、0.15、0.3mmol.L-1;引物为0.065、0.2、0.4μmol.L-1,并对合适退火温度进行研究。筛选出的RAMP优化体系为(20μL):dNTPs 0.15 mmol.L-1,Mg2+1.5 mmol.L-1,引物0.2~0.4μmol.L-1,DNA10 ng,Taq E 0.8U;PCR扩增程序为94℃3 m in,94℃1 m in,45℃1 m in,72℃1.5 m in,42个循环,72℃8 m in。运用此体系,进行引物组合筛选,并对7个萝卜品种的遗传多样性与品种鉴定进行RAMP标记分析。