香蕉幼果SSH文库构建及初步分析

编号 zgly0001444101

文献类型 期刊论文

文献题名 香蕉幼果SSH文库构建及初步分析

作者 颜园园  王静毅  冯素萍  陈友  武耀廷 

作者单位 海南大学农学院  中国热带农业科学院热带生物技术研究所  农业部热带作物生物技术重点开放实验室  琼州学院 

母体文献 果树学报 

年卷期 2013年03期

年份 2013 

分类号 S668.1 

关键词 皇帝蕉  果实发育  抑制差减杂交  cDNA文库 

文摘内容 【目的】构建香蕉果实发育抑制差减文库,筛选果实发育相关基因。【方法】以皇帝蕉幼果为实验组,幼叶为对照组,构建差减文库,并用Blast2GO软件进行生物信息学分析。【结果】挑选982个重组子菌液PCR筛选cDNA文库,得到750个候选克隆。对其中200个克隆进行测序、去载体序列、拼接后,获得92个unigenes。在GenBank中进行同源性比较,共有81个找到同源序列,11个cDNA未找到同源序列。75个unigenes在GO数据库中有功能注释,涉及到的细胞组分、分子功能和生物过程分别为53个、72个和60个,显示果实发育差异主要与在细胞内部组分进行的代谢过程的强度,以及其他一些因子和激酶的影响有关。【结论】成功构建皇帝蕉果实的差减cDNA文库,为进一步开展香蕉果实发育相关基因如tubulin、P450等基因的克隆及功能鉴定奠定了重要基础。