杧果TRAP标记反应体系的优化与引物筛选

编号 zgly0001494619

文献类型 期刊论文

文献题名 杧果TRAP标记反应体系的优化与引物筛选

作者 罗纯  武红霞  姚全胜  王松标  许文天  马小卫 

作者单位 农业部热带果树生物学重点实验室/中国热带农业科学院南亚热带作物研究所 

母体文献 中国南方果树 

年卷期 2015年04期

年份 2015 

分类号 S667.7 

关键词 杧果  TRAP  体系优化  引物筛选 

文摘内容 为了建立杧果目标区域扩增多态性(TRAP)标记技术体系,对影响该反应体系的Mg2+、dNTPs、固定引物浓度、随机引物浓度以及Taq DNA聚合酶等5个因素进行优化。确定优化的反应体系总体积为15μL,包括模板DNA 40ng、1×buffer、Mg2+1.4mmol/L、dNTPs 0.2mmol/L、固定引物0.8μmol/L、随机引物0.04μmol/L、Taq酶1.7U。利用杧果公共数据库抗病基因相关序列设计锚定引物13条,与7条随机引物组合共91对引物。利用这些引物对杧果品种进行TRAP-PCR扩增,其中66个引物组合能扩增出清晰条带,且表现出良好的多态性,占引物总量的72.53%。