编号
zgly0001449188
文献类型
期刊论文
文献题名
蓝舌病病毒VP7蛋白的B细胞表位预测
作者单位
广西大学动物科技学院
军事医学科学院野战输血研究所国家生物医学分析中心病毒安全检测实验室
母体文献
中国动物传染病学报
年卷期
2013年01期
年份
2013
分类号
S852.65
关键词
蓝舌病毒VP7蛋白
B淋巴细胞表位
二级结构
预测
文摘内容
根据前期试验中测得的蓝舌病病毒VP7蛋白的基因序列和推导的氨基酸序列,利用DNAStar软件和Biosun软件进行生物信息学预测,以单参数(亲水性、可及性、柔韧性、抗原性)预测为基础,结合二级结构预测来综合分析蓝舌病病毒VP7蛋白的B细胞表位。比较两种软件的预测结果发现,在蓝舌病病毒VP7蛋白的381个氨基酸序列中,第81~85、198~202、235~239、253~257区域有较好的亲水性、表面可及性和较高的抗原指数,并且在二级结构上含有易形成抗原表位的转角和无规则卷曲,最有可能为蓝舌病病毒VP7蛋白的B细胞线性优势表位。上述预测和判定结果表明,在蓝舌病病毒VP7蛋白序列中存在优势B细胞线型表位,为进一步合成多肽并分析已获得的VP7蛋白单抗的结合表位奠定了基础。