茶树WRKY转录因子的鉴定与分析

编号 zgly0001566509

文献类型 期刊论文

文献题名 茶树WRKY转录因子的鉴定与分析

作者 罗勇  陈丝  欧淑琼  石玉兰  郑楚楚  刘仲华  王坤波  黄建安 

作者单位 湖南农业大学茶学教育部重点实验室  国家植物功能成分利用工程技术研究中心  湖南省植物功能成分利用协同创新中心 

母体文献 分子植物育种 

年卷期 2017年10期

年份 2017 

分类号 Q943.2  S571.1 

关键词 茶树  WRKY  转录因子  生物信息学  表达模式 

文摘内容       本研究以三个不同品种的茶树叶片转录组数据为材料,通过PAFM、SMART数据库对茶树WRKY转录因子进行严格搜索与鉴定,得到45个茶树WRKY转录因子,利用生物信息学的方法分析了茶树WRKY蛋白的一级结构性质、分类、系统发生学和保守结构域等特征。结果表明,茶树基因组至少存在45个以上的WRKY转录因子,氨基酸数在44~613之间,部分WRKY不稳定,约占11%;根据WRKY结构域的数量及锌指结构特征可将其分为GroupⅠ、GroupⅡ和GroupⅢ三大类,GroupⅡ可分成多个亚类,有部分成员的七肽保守域和锌指结构域发生了突变;三级结构显示,茶树WRKY蛋白保守结构域含5个β折叠。采用比较转录组学的方法研究了茶树WRKY转录因子的表达模式,结果表明,不同茶树品种间存在较多的差异WRKY基因,有的呈显著上调表达趋势,有的下调表达;该研究是茶树WRKY基因进化及功能研究的理论基础,对进一步揭示不同茶树品种间差异性状的形成机理和转录调控机制具有重要意义。