苹果WRKY转录因子家族基因生物信息学分析

编号 zgly0001420023

文献类型 期刊论文

文献题名 苹果WRKY转录因子家族基因生物信息学分析

作者 许瑞瑞  张世忠  曹慧  束怀瑞 

作者单位 潍坊学院生物与农业工程学院  山东省高校生物化学与分子生物学重点实验室  山东农业大学园艺科学与工程学院  国家苹果工程技术研究中心 

母体文献 园艺学报 

年卷期 2012年10期

年份 2012 

分类号 S661.1 

关键词 苹果  WRKY  转录因子  生物信息学 

文摘内容 利用生物信息学方法对苹果MdWRKY转录因子家族成员、基因分类、染色体定位、系统进化关系和结构域序列保守性进行了预测,并分析基因在果实成熟期和砧穗互作中的表达差异。苹果MdWRKY家族包含116个基因,分为GroupⅠ、GroupⅡ和GroupⅢ,其中GroupⅡ又可细分为GroupⅡa、GroupⅡb、GroupⅡc、GroupⅡd和GroupⅡe亚类;苹果的17条染色体均有WRKY转录因子分布,其中第1条染色体上的分布最多,有12个WRKY基因分布。MdWRKY编码的蛋白在118～965个氨基酸范围内,等电点位于4.81～10.16之间。Microarray分析发现,在苹果果实成熟时期和砧木接穗互作过程中,多数MdWRKY基因的表达都有不同程度的变化。